7SK RNA

Moleküler biyolojide 7SK, metazoan'da bol bulunan küçük bir nükleer RNA`dır.[1] Pozitif transkripsiyon uzatma faktörünün P-TEFb kontrol transkripsiyonunu düzenlemede önemli bir rol oynar. [2] 7SK kompleksinin stabilitesi ve fonksiyonunu düzenleyen diğer proteinler küçük bir nükleer ribonükleoprotein kompleksinde (snRNP) bulunur.

Yapı

İlk araştırmalar hücrelerinde 7SK`nın bir dizi protein ile birlikte ve belirtilen tarama bölgesinin sekonder yapıdaki RNA`nın farklı bölgeleri arasında baz çiftleşmesi için bir model olduğunu göstermiştir. [3] 7SK snRNP işlevinde bir atılım bulgusu ile verilen pozitif transkripsiyon uzatma faktörü p-TEFb kompleksinin bileşenidir.[4][5] 7SK, HEXIM1[6][7] veya HEXIM2 [8][9] RNA bağlama proteinlerinin etkisiyle P-TEFb'nin siklin bağımlı kinaz aktivitesini birleştirir ve inhibe eder. 7SK'nın 5 'ucundaki gama fosfat, 7SK snRNP'nin kurucu bir bileşenini oluşturan metilfosfat kapatma enzimi MEPCE tarafından metilasyona tabi tutulur.[10] La ilişkili protein LARP7’ninde, RNA'nın 3' ucu ile etkileşim yoluyla; 7SK parçasının kısmen ilişkisi bulunmuştur. [11][12][13] SiRNA aracılı demonte tarafından MEPCE veya LARP7` ye azaltılması, in vivo olarak 7SK istikrarsızlığına yol açar.7SK snRNP`lerin bir alt kümesi, p-TEFb ve HEXIM`den yoksundur bunun yerine hnRNPs içerir.

İşlev

7SK snRNP'nin esas işlevi, transkripsiyonun uzama fazını düzenleyen bir faktör olan P-TEFb'nin kontrolüdür. [2] Faktörü 7SK snRNP olduğunda, p-TEFb kinaz aktivitesi inhibe edilir. P-TEFb, HIV transaktivatör tat ya da bromodomain içeren proteinin (BRD4) biri ile 7SK snRNP serbest bırakılabilir. Bu durum, 7SK RNA`nın bir konformasyonel değişikliğine ve HEXIM’in dışarı atılmasına yol açar. [14] HnRNP'ler, P-TEFb ve HEXIM'den yoksun kompleksi stabilize eder. P-TEFb, spesifik genler üzerinde işlev gördükten sonra bilinmeyen bir mekanizma ile 7SK snRNP'ye yeniden kenetlenir. 7SK snRNP hem insan hem de Drosophila'da karakterize edilmiştir. [15] [16]

Referanslar

  1. ↑ "7SK RNA, a non-coding RNA regulating P-TEFb, a general transcription factor". RNA Biology 6 (2): 122–8. 2009. PMID 19246988. http://www.landesbioscience.com/journals/rnabiology/article/8115/?nocache=926590083.
  2. 1 2 "7SK snRNA: a noncoding RNA that plays a major role in regulating eukaryotic transcription". Wiley Interdisciplinary Reviews. RNA 3 (1): 92–103. 2012. DOI:10.1002/wrna.106. PMC 3223291. PMID 21853533. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wrna.106/pdf.
  3. ↑ "Structural analyses of the 7SK ribonucleoprotein (RNP), the most abundant human small RNP of unknown function". Molecular and Cellular Biology 11 (7): 3432–45. July 1991. DOI:10.1128/MCB.11.7.3432. PMC 361072. PMID 1646389. http://mcb.asm.org/content/11/7/3432.long.
  4. ↑ "7SK small nuclear RNA binds to and inhibits the activity of CDK9/cyclin T complexes". Nature 414 (6861): 322–5. November 2001. DOI:10.1038/35104581. PMID 11713533. http://www.nature.com/nature/journal/v414/n6861/full/414322a0.html.
  5. ↑ "The 7SK small nuclear RNA inhibits the CDK9/cyclin T1 kinase to control transcription". Nature 414 (6861): 317–22. November 2001. DOI:10.1038/35104575. PMID 11713532. http://www.nature.com/nature/journal/v414/n6861/full/414317a0.html.
  6. ↑ "MAQ1 and 7SK RNA interact with CDK9/cyclin T complexes in a transcription-dependent manner". Molecular and Cellular Biology 23 (14): 4859–69. July 2003. DOI:10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003. PMC 162212. PMID 12832472. http://mcb.asm.org/content/23/14/4859.long.
  7. ↑ "Inhibition of P-TEFb (CDK9/Cyclin T) kinase and RNA polymerase II transcription by the coordinated actions of HEXIM1 and 7SK snRNA". Molecular Cell 12 (4): 971–82. October 2003. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00388-5. PMID 14580347. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276503003885.
  8. ↑ "HEXIM2, a HEXIM1-related protein, regulates positive transcription elongation factor b through association with 7SK". The Journal of Biological Chemistry 280 (16): 16360–7. April 2005. DOI:10.1074/jbc.M500424200. PMID 15713662. http://www.jbc.org/content/280/16/16360.long.
  9. ↑ "Compensatory contributions of HEXIM1 and HEXIM2 in maintaining the balance of active and inactive positive transcription elongation factor b complexes for control of transcription". The Journal of Biological Chemistry 280 (16): 16368–76. April 2005. DOI:10.1074/jbc.M500912200. PMID 15713661. http://www.jbc.org/content/280/16/16368.long.
  10. ↑ "Systematic analysis of the protein interaction network for the human transcription machinery reveals the identity of the 7SK capping enzyme". Molecular Cell 27 (2): 262–74. July 2007. DOI:10.1016/j.molcel.2007.06.027. PMID 17643375. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276507004170.
  11. ↑ "LARP7 is a stable component of the 7SK snRNP while P-TEFb, HEXIM1 and hnRNP A1 are reversibly associated". Nucleic Acids Research 36 (7): 2219–29. April 2008. DOI:10.1093/nar/gkn061. PMC 2367717. PMID 18281698. http://nar.oxfordjournals.org/content/36/7/2219.long.
  12. ↑ "The La-related protein LARP7 is a component of the 7SK ribonucleoprotein and affects transcription of cellular and viral polymerase II genes". EMBO Reports 9 (6): 569–75. June 2008. DOI:10.1038/embor.2008.72. PMC 2427381. PMID 18483487. http://www.nature.com/embor/journal/v9/n6/full/embor200872.html.
  13. ↑ "A La-related protein modulates 7SK snRNP integrity to suppress P-TEFb-dependent transcriptional elongation and tumorigenesis". Molecular Cell 29 (5): 588–99. March 2008. DOI:10.1016/j.molcel.2008.01.003. PMID 18249148. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1097276508000361.
  14. ↑ Blagosklonny, Mikhail V., ed. (August 2010). "The mechanism of release of P-TEFb and HEXIM1 from the 7SK snRNP by viral and cellular activators includes a conformational change in 7SK". PloS One 5 (8): e12335. DOI:10.1371/journal.pone.0012335. PMC 2925947. PMID 20808803. http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0012335.
  15. ↑ "The Drosophila 7SK snRNP and the essential role of dHEXIM in development". Nucleic Acids Research 40 (12): 5283–97. July 2012. DOI:10.1093/nar/gks191. PMC 3384314. PMID 22379134. http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2012/02/29/nar.gks191.long.
  16. ↑ "Cracking the control of RNA polymerase II elongation by 7SK snRNP and P-TEFb". Nucleic Acids Research 44 (16): 7527–39. September 2016. DOI:10.1093/nar/gkw585. PMC 5027500. PMID 27369380. http://nar.oxfordjournals.org/content/44/16/7527.long.
This article is issued from Vikipedi - version of the 12/30/2016. The text is available under the Creative Commons Attribution/Share Alike but additional terms may apply for the media files.